数十艘10丈长的大船则改造为两层的中型战舰，设置20棹、40名水手。下层设置30排座位，每排坐6人。上层为战舱，左右两壁开设箭窗，用于水战放箭。夜晚作为水手、舵手的卧室。舱顶也安装了栏杆和信号杆。
攻打三汊河水寨时，每条魛鱼舰只载20名披挂牛皮甲衣的弓箭手、10个点火兵。快速逼近敌船后，发射火苗箭突袭。大火把曼济哈雅的水师烧得狼狈不堪。
首次和元军水战，虽然歼敌数量很少，但是烧毁、烧损10余艘中型敌舰。这使朱元璋及全体将士渡江作战的信心大增。接着，朱元璋召开庆功大会，请李善长宣布嘉奖名单和任命书。
任命廖永安为水师一军镇抚，郑遇春为水师一军军需总管。任命俞通海为水师二军镇抚，俞廷玉为水师二军军需总管。水战需要大量箭矢、燃油、铠甲等。
第二天，朱元璋迫不及待，在自己的帅府与各位将领商议渡江计划。
朱元璋以元军水兵训练红军，首战告捷，马上又论功行赏，廖永安对他的领导才能钦佩不已。在会上带头发言说：“朱公，三汊河一仗，旗开得胜，士气高涨，我们可以一鼓作气，顺江而下，直取集庆（今南京）。”
俞通海、郑遇春随声附和。常遇春、徐达、赵德胜也纷纷赞同。
朱元璋则说：“诸位兄弟，攻主营，应先拔附寨，剪断主营的羽翼，以免背后或两翼受敌。”
他把廖永安、俞通海叫到中堂前的方桌旁，指着桌面的地图说：“取集庆，应先占采石矶。采石矶是北上集庆、南下芜湖、铜陵的咽喉，离集庆100多里（57公里多）。得采石，可占领太平（当涂县城）得到足够的粮草，然后攻打集庆就有了稳便的后备。”
这张图，朱元璋已经看了很多遍。他说的“采石”是指广义采石矶，长约7公里。
1355年（乙未岁）农历六月乙卯朔日（初一），朱元璋携冯国用、冯国胜、李善长随廖永安同乘指挥船；总管邓愈、镇抚花云、徐达、郭兴等随廖永忠带领一万士兵乘坐50艘改造的大渔船为前军。
总管汤和、镇抚耿再成、吴良等随俞通海引领一万士卒乘坐200多艘改造的魛鱼船作为二路军随后。
郑遇春和俞廷玉带数十条军需及护卫船殿后。船队浩浩荡荡奔向长江。
当前军刚刚驶出针鱼嘴，忽然后方数十里黑云遮天，顷刻间雷电、风雨接踵而至。廖永安下令沿江边停泊。
次日丙辰（初二），大雨停止，一团团云彩由西北向东南移动，刮起了西北风。廖永安、俞通海的水手欢呼雀跃，朱元璋的步兵莫名其妙。
随着廖永安一声令下，指挥船舱顶信号杆的左右挂上了两面蓝幡旗，发出排成两行行军的命令。然后升起白帆，拔锚起航、逆流而上。
相隔数米的各船依次在信号杆挂上两面蓝幡旗，升起船帆尾随而行。
从针鱼嘴到正南偏东的石质采石矶（又名牛渚矶）前端有10多公里。由东岸向西北伸入江中的采石矶长约两公里，北面是翠螺山。山的东面是采石镇。采石矶西缘沿江向南延伸接近太平州（当涂县城）西北角，岸线长约7公里，两头尖，中间宽。腰部最宽处约1.3公里。
这是广义的采石矶。其东缘一条采石河把它与东面的陆地分开。
廖永安要再次明确主攻方向，向朱元璋问道：“是攻采石镇还是采石矶？”
朱元璋答道：“采石乃大镇，其备必固。采石矶前临大江，彼难备御。今往攻之，其势必克！”
廖永安应道：“属下明白了。”随之下令朝采石矶进发。
广义采石矶西面有一个很大的江心洲，两者之间的长江是分流的次航道，最宽处约600米，最窄处约300米。
朱氏红军的兵船进入牛渚矶航道，没有看见沿岸驻扎军队。过了石质牛渚矶进到约4公里时，发现前方岸上有元军的栅栏战墙。战墙高约1.3米，成l形布置，北墙东头延伸到采石河边，长约1000米，西墙长约500米。战墙西北角有一座岗楼。栅栏区南面是营寨。过了兵营，就是官渡，离太平城西北江岸还有7里地。
廖永安命令指挥船抛锚，停在江心，接着下令前军靠岸。传令兵马上取下信号杆的蓝幡旗，挂上一面绿幡旗，传递靠岸命令。前军各船接着依次挂上綠幡旗。
元军的哨兵已经发现红军，吹响了报警的号角。很快，岗楼西侧战墙打开一扇门，钻出500人的长弓部队，快速运动到江边，排成两行。这时，十条先锋船已近岸100米之内，进入长弓有效射程。元军长弓队迅速分为25个小队，以20人排成两排攻击一条兵船。
长弓队指挥官下令“放箭”后，依次成排发射的箭矢犹如急速的阵雨，飞击兵船。前甲板的士兵有的已经中箭。舟船越是接近岸边，甲板上中箭的士兵越多。长弓箭着实给了朱氏红军一个下马威。
邓愈急中生智，命令前排持盾士兵蹲下，后排士兵持盾置于前排盾上，组成盾墙。这里的镇戌军是探马赤军，训练有素，擅长骑射，舟船无法猝然靠岸。
先锋队第一艘大船逼近江岸3丈（约9.5米）左右时，渡江先锋常遇春已从这艘大船的尾部跳到一支跟随的10浆小艇上，命令冲上去。他站立船头，左手持盾挡箭，右手紧握双钩枪。十个背刀水兵分坐两行拼命划桨，犹如龙舟竞渡，小艇飞驰靠岸。
真可谓：孤帆旗去疾，一艇箭回初。
水师指挥廖永安见状，下令小艇冲锋靠岸。传令兵的双手立刻向船队挥舞两面三角形红旗，发出小艇进攻命令，信号依次传递。转眼间，前军每艘大船携带的两条小艇纷纷冲向岸边。
采石矶毕竟太长，元军的500人长弓队只能防守500米。前军后部25艘兵船因无箭阻击，迅速靠岸。
不等小艇完全靠岸，常遇春即纵身一跃跳上陆地，像头雄狮，面目狰狞冲入敌阵。他的双钩枪急速地又戳又砍，凶猛异常，瞬间杀死几名长弓手，
10名水兵紧跟而上，挥舞着手刀。两边的弓手吓得转身就跑。有数十条小艇也迅速靠岸，数百名手刀兵纷纷登陆，冲向敌阵。弓箭手已无优势，望风披靡，跑得慢的，立刻成了刀下之鬼。
元军江边长弓阵虽然溃败，但是栅栏战垒内还有500长弓手。他们纷纷向江边红军发射乱箭，掩护溃败的同伙逃回战垒。
前军兵船接二连三靠岸后，数千红军在总管邓愈、镇抚花云、徐达、郭兴、和千夫长陆仲亨、丁德兴及先锋赵德胜等将校的带领下拉开几百米宽，排山倒海，从北面冲进栅栏战墙，击溃了元军的大刀部队，一直杀到南端，最后杀进他们位于官渡的兵营，消灭和俘虏元兵共三千人。
登陆晚的部队都捞不到仗打，只好打扫战场。朱元璋这一仗可谓先难后易，摧枯拉朽，不到一个时辰（两小时）就结束了战斗，占领了太平城的江岸门户采石矶。
当天中午，朱元璋宣布：晋升廖永安为水师两军总管，廖永忠为水师一军镇抚。晋升常遇春为水、步军镇抚兼水师总管府先锋，统领张德胜、叶升、桑世杰、华高及水兵两千、步兵一千。
打了大胜仗，年轻的小头领们头脑开始糊涂、发热，他们以和州物质匮乏为由，纷纷要把缴获的战利品搬上船，运回和州，随便想把一些从元军官兵身上没收的钱财拿给家人。这些小头领既有水师的，也有徐达手下的。
朱元璋闻讯后，马上把徐达和廖永安叫到自己的帅帐，告诫说：“今举军渡江幸而克捷，当乘胜径取太平。若听任诸军取财物以归，再举必难！江东非我有，则大事去矣！”
两位将领沉默了一会，徐达表态说：“朱帅教训的是。”
廖永安跟着说：“请朱帅明示！”
朱元璋想了一下，说道：“廖总管听令：悉断舟缆，推舟急流中。”
廖永安愣了一下，问道：“朱公，尔说甚？”
朱元璋又严肃认真地重复一遍：“悉断舟缆，推舟急流中。”
廖永安马上抱拳应道：“遵命！”
打算携带战利品返回和州的将领看见水兵砍断缆绳，把50艘大船推入江中，让其顺流而下，大惊失色！其他将领也都莫名其妙。纷纷跑到帅帐，询问朱元帅。
朱元璋板着脸说道：“成大事者不谋小利。此去太平甚近，舍弃不取将何为？”
徐达给下属使了使眼色。
19岁的千夫长陆仲亨听出了朱元璋的话外之音，又见徐达示意，慌忙抱拳表态说：“恭听元帅号令！”
其余的也急忙抱拳附和说：“恭听元帅号令！”
朱元璋接着下令：“全军吃饭。吃罢攻打太平！”
大小将校离开后，朱元璋叫谢成秘密通知廖永安，派廖永忠带兵划小艇追取大船，开到采石矶北面的翠螺山待命。
元末，江浙行省太平路辖当涂县、芜湖县、繁昌县。治所在当涂县，属于路、县衙门同城。
东晋成帝（司马衍）咸和四年（329年），江淮间战乱，多数难民南渡过江。于是在江南始设当涂县及淮南郡，以安置流民。
唐高祖（李渊）武德元年（618年），当涂县改属宣州（今属安徽）。
五代南唐（李升）升元元年（937年），改当涂县为建平军，南唐（李璟）保大末年（957年）又改作雄远军。
宋太祖（赵匡胤）开宝八年（975年），改雄远军为平南军。宋太宗（赵匡义）太平兴国二年（977年），升平南军为太平州。当涂县为附城，隶属建康府路（今南京）。
太平兴国三年，划宣州之芜湖、繁昌2县归太平州。
元世祖（忽必烈）至元十四年（1277年），改太平州为太平路，隶属江浙行省，辖县如故。治所还是在当涂县城。
宋元当涂城的平面约为四方梯形，周长10.8里（约合6159米），坐南朝北，背依姑溪河。此河自东南向西北流入长江。当涂城的南墙依河而建，平面成斜线。宋朝建造者顺应地利在东、西、北面开挖护城壕沟，但在东、西、北三门处的壕沟留下两丈（约6.3米）宽的进城道路。路中先挖沟埋入通水陶管，从东南角引入姑溪河水，并建有一坝，设置了水闸，以防洪水。西城濠连通姑溪河。部分河水经过城东、城北、城西，最后又流入姑溪河。
东城墙长约3.5里（1996米），有一门，正门居中偏南，叫行春门。
西城墙长约3里（1711米），有一门，居中偏南，叫澄江门。一条大街把东西两门连通。
北城墙长约2.3里（1312米），有一门，偏西，叫清源门。
南城墙长约2里（1140米），有一门，偏西，叫南津门。意思是：南临渡口之门。
一条垂直大街把南北两门连通。平日，商船云集姑溪河，挑夫频繁进出南津门。由于城东墙略成弧形，中部向东面突出，西墙轴线又偏斜、向东，故南墙比北墙短。护城濠基本沿着城墙走向开挖，也不是方方正正。
城墙四角建有突出的弧形敌楼，可以从侧面有效射杀50米以内攻城的敌兵。
北门和东门外地势开阔，便于大批部队集结及排兵布阵。
当天下午，汤和派出的探子回来报告：攻打采石矶时，当涂城的四门已经关闭，全城戒严，白天也不打开。派人混进城里应外合是不行了。
这已在朱元璋的预料之中。渡江前，朱元璋就派探子到太平州调查了当涂城的情况，确定了攻城方案。他把主攻方向定在北门和东门。这次，他带上了攻打滁州的利器——撞门车。
太平州的官渡距离当涂城北门2.5公里。当天下午，按照计划，总管汤和、
邓愈兵分两路到达城东和城北。两辆撞车分别拖到两门外约80米处，盖着青布。守城的元军不知为何物，莫名其妙。
撞车后面站着三排18人的弓箭手，负责掩护。再后面是四路步兵纵队——每路纵队1000人，分为两行。前面是5位骑马的将领。
东门带队攻城的将领是：总管汤和、镇抚张赫、常遇春、千夫长张德胜、周德兴。北门带队攻城的将领是：总管邓愈、镇抚花云、徐达、千夫长郑遇霖、陆仲亨。
汤和、邓愈分别一声令下，青布被扯掉，撞车开始前进。元军恍然大悟，慌忙放箭。
这就是出其不意，攻其不备。如果元军知情，事先准备燃油、火苗箭，采用火攻阻击撞车，后果不堪设想。
撞车进到城门前，接着不停地撞啊、撞啊！三排弓箭手轮流向城头放箭，掩护6个撞车兵。
撞了十来分钟，门撞开了。汤和、常遇春和吴良带领4路纵队依次冲进东门，邓愈、花云和徐达引领4路纵队依次冲进北门。他们按照计划分别杀向城头、兵营、路府、万户府、总管府等处。
元朝上路（十万户之上）总管府设置达鲁花赤一名（镇守长官，蒙古人担任）、总管（兼管劝农事）一名（汉人担任），均为正三品；设同知（回回人担任）、治中、判官各一名，均为从三品。
元朝各路管辖军队七千人以上机构为上万户府，设置达鲁花赤一名（蒙古人担任）、万户（将领）一名，均为正三品；副万户（将领）一名，从三品；设经历（文职）一名，从七品；知事（文职）一名，从八品。
朱氏红军以撞车奇袭、破城，吓得太平路元臣平章政事（从一品）颚勒哲布哈和同佥（正四品）张旭等人惊恐不已，弃城而逃。
各路红军势不可挡，太平路万户将领纳克楚被活捉，朱氏红军很快攻占了全城，大批元军将士投降。
太平路总管府总管汉人靳义不愿投降，跑出东门跳进护城河自尽，做了元廷之鬼。
朱元璋听说后，感慨道：“他是义士啊！”随后，叫人打捞起来，买了一口棺材把他埋了。
这次攻打采石矶，朱元璋再次领教长箭的威力。渡江首战告捷，缴获元军1000支长弓，朱元璋眉开眼笑，下令组建了自己的第一支长弓部队，由镇抚郭兴统领。
注释：
1剥肤椎髓：剥掉皮肤、锤骨吸髓。比喻残酷剥削。
2万户：元朝武官职。中万户府，管军五千之上。万户从三品，发虎符（虎牌）凭证；副万户正四品，发金牌凭证。下万户府，管军三千之上。万户从三品，发虎符凭证；副万户从四品，发金牌凭证。
3千户：元朝武官职。上千户所，管军七百之上。千户从四品，发金牌凭证；副千户正五品，发金牌凭证。中千户所，管军五百之上。千户正五品，发金牌凭证；副千户从五品，发金牌凭证。下千户所，管军三百之上。千户从五品，发金牌凭证；副千户正六品，发银牌凭证。
4百户：元朝武官职。上百户所，百户从六品，发银牌凭证。下百户所，百户从七品，发银牌凭证。